Стереоскопические микроскопы ответвляются от других световых микроскопов для просмотра «3D»-объектов. К ним относятся крупные образцы, такие как насекомые, перья, листья, камни, песчинки, драгоценные камни, монеты и марки и т. д. Функционально стереоскопический микроскоп похож на мощную лупу. В отличие от составного микроскопа, который дает плоское изображение, стереоскопические микроскопы предоставляют наблюдателю трехмерное изображение, позволяющее увидеть текстуру более крупного образца.